Kravet om hygiejne- og miljøkontrol gælder for følgende 3 segmenter:
Ved råvarer kræves en analyse af den naturlige mikroflora, før de kan blive integreret i fremstillingsprocessen
Processer - Under forarbejdning af fødevarer, kan mikroorganismer blive ødelagt (opvarmning proces, ..) eller ved stress - Ved nogle processer, føjes mikroorganismer til processen (gæring..)
Økosystemet i det færdige produkt indeholder screeninger for nedbrydelse og patogene mikroorganismer og toksiner
Kontaminering kan forekomme under hele processen via luft, overflader eller mennesker.
